Федеральное государственное бюджетное учреждение науки
Лимнологический институт Сибирского отделения Российской академии наук
+7 (3952) 42-65-04
[email protected]

Младший научный сотрудник (0.1 ставки) в лабораторию водной микробиологии (специальность 1.5.15. Экология)

Деятельность: Проведение исследований генетического и таксономического состава, структуры и метаболического потенциала микробных сообществ водных экосистем, сборка и функциональная аннотация геномов культивированных микроорганизмов и восстановленных из природных популяций.

Трудовые функции: Выполнение отдельных заданий в рамках решения задач исследования. Сбор научной информации по теме исследования, проведение молекулярно-биологических исследований и биоинформатического анализа; обработка и анализ научных данных, результатов экспериментов и наблюдений; освоение новых методов и подходов к анализу и обработке полученных результатов.

Трудовая деятельность: Участие в экспедиционных работах по отбору проб бактериопланктона. Изучение научной литературы по специальности. Подготовка обзоров на основе собственных и литературных данных. Изучение биоинформатических инструментов анализа данных секвенирования. Обработка и анализ генетических данных, полученных с использованием высокопроизводительного shotgun и таргетного секвенирования природных микробоценозов и культивированных микроорганизмов. Исследование таксономического разнообразия микробных сообществ пресных водоемов. Исследование функционального состава, метаболического потенциала микробных сообществ и геномов бактерий. Статистический анализ и анализ методами машинного обучения результатов высокопроизводительного секвенирования, биотических и абиотических данных и их визуализация при помощи программных пакетов и языков программирования: R, Python, C++. Участие в подготовке и написании отчётов и статей.

Требования к квалификации и результативности научной деятельности: Высшее профессиональное образование и опыт работы по соответствующей специальности. Владение методами подготовки проб и выделения ДНК. Знание языков программирования и современных подходов в области обработки и анализа биологических данных, которые включают машинное обучение, статические методы и биоинформатические программные инструменты. Наличие за последние 5 лет: не менее 5 научных статей в журналах, индексируемых в базах данных WoS и Scopus, в 1 из них с первым авторством.